40% tanah yang akan digunakan untuk lapangan terbang diklasifikasikan sebagai tanah " Paku Alam (Duke) " sementara selebihnya milik masyarakat tempatan. Lokasinya berada di Kabupaten Temon antara Pantai Congot dan Pantai Glagah (yang meliputi desa Palihan, desa Sindutan, desa Jangkaran dan desa Glagah). [12] [13]

Penduduk yang terlibat mengetahui mengenai pembinaan YIA pada tahun 2011. Penyebaran pembangunan YIA dilakukan oleh Pemerintah Daerah dan Pejabat terkait, PT Angkasa Pura I, dan Badan Tanah Nasional (BPN) Kabupaten Kulon Progo pada tahun 2014. Penolakan oleh orang yang terlibat dilindungi oleh media massa. Alasan orang menolak YIA yang dirancang adalah pembinaan lapangan terbang akan menghilangkan tanah yang menjadi sumber kehidupan mereka sebagai petani. Mereka juga mengaku tentang masalah alam sekitar dengan laman web yang dicadangkan serta masalah keselamatan, kerana kawasan tersebut berisiko tinggi untuk tsunami dan bencana alam lainnya. [14] Di samping itu terdapat beberapa tempat bersejarah dan menakutkan bagi komuniti tempatan dengan kawasan pembangunan lapangan terbang. Penolakan terhadap pembangunan YIA telah bermula sejak penubuhan Wahana Tri Tunggal (WTT). Kemudian beberapa anggotanya membentuk Persatuan Komuniti untuk Menolak Pengusiran Kulonporogo (PWPP-KP). Pada mulanya, sikap menolak tanpa syarat menjadi prinsip WTT terhadap pembinaan YIA, sehingga akhirnya mereka menerima pembinaan dengan syarat ada penilaian semula aset bangunan, kilang dan kemudahan sokongan lain. Sementara itu, dari pembentukan PWPP-KP hingga sekarang, sikap menolak tanpa syarat masih berterusan. [15] Sehingga Julai 2018, terdapat 86 keluarga yang masih enggan menjual tanah mereka untuk pembangunan lapangan terbang. [16]

Pada 28 November 2017, Ketua Ombudsman Indonesia meminta penundaan mengosongkan tanah penduduk kerana mereka sedang menjalankan siasatan mengenai kemungkinan penyelewengan dalam proses tersebut. Suruhanjaya Hak Asasi Manusia Nasional Indonesia (Komnas HAM) mengatakan bahawa pengendalian warga di kawasan konflik YIA relatif baik dibandingkan dengan konflik di banyak daerah lain dengan tahap konflik yang lebih kompleks. [17] Pada masa yang sama, Suruhanjaya Hak Asasi Manusia menganggap ada pelanggaran hak asasi manusia yang terjadi dan tidak perlu dilakukan dalam mengosongkan tanah yang dihuni oleh penduduk. [18]